园区地处莆田市湄洲湾港北岸。湄洲湾是莆田三大港湾之一，被孙中山先生誉为“世界不多，中国少有”的天然深水良港。莆田市位于福建省经济最活跃的闽东南沿海中部、台湾海峡西岸，处于省会城市福州和特区城市厦门之间、长江三角洲和珠江三角洲之间。莆田是海峡两岸人民交流合作的前沿平台，东南沿海区域性交通枢纽。　　湄洲湾港区水深港阔，不冻不淤、风平浪静，是全国四大国际中转港之一，湄洲湾秀屿港为国家一类港口，已建成5万吨级多用途各类码头19个，与世界许多国家和地区港口通航。园区规划建设5-15万吨级深水泊位40个，拟建成年吞吐量超亿吨的大型深水港口。　　园区距福厦铁路莆田站仅19公里。建设中的向莆铁路从江西向塘直通福厦铁路莆田站，湄洲湾港口铁路支线自莆田站引出，进入园区，通往湄洲湾秀屿港、东吴港及罗屿码头作业区，其编站组就设在园区。　　紧邻园区的秀港大道，穿过园区的莆永高速、城港大道、荔港大道、沁桥路，纵横贯通形成园区向市区及沿线各大城市辐射的快捷绿色通道；从园区乘车5分钟上福厦高速，大概15分钟就可抵达市中心。