福州市科技园区于1991年经国务院批准成立，是首批27个国家级高新技术产业园区之一，也是唯一一个依托乡镇创办的国家级高新技术产业园。创办时规划面积为3.6平方公里，现仅为0.4平方公里，四至范围是杨桥路以南、福屿路以西、乌山西路以北、工业路北段两侧。
2014年3月5日，国务院同意福州市科技园区更名为福州高新技术产业开发区。
福州市科技园区从开创以来，先后投入20多亿元资金进行水、电、路、气、环保、通讯等基础设施配套建设，兴建了50多万平方米标准厂房。园区发挥国家高新技术产业开发区的孵化功能，通过良好服务、资金扶持，孵化出一批诸如梅生、金得利实达、新大陆、创识、华融、金山药业、宏智集团等一批在电子信息、生物医药、新材料以及环保和软件产业高新技术领域中具有自主知识产权的高新技术企业；以良好的软、硬投资环境吸引了中华映管、LG、NEG、EPSON、三协精机等世界着名的跨国公司前来投资办厂，形成了电子信息占70%、光机电一体化占8%、生物工程占12%、新材料占10%的高新技术产业群体，已初步形成了具有地方优势和特色的支柱产业。
福州市科技园区从创建以来，兴办了科技企业300余家，认定高新技术企业101家，其中：高新技术产品产值超10亿元的企业2家，超亿元的16家，5000万元以上的27家。在园区创业的28648人员中大专以上学历的占8865人，科技和研发人员占3373人，开发出新产品600多项，其中：国家级火炬计划项目60项，省级火炬计划项目97项。累计实现工业总产值724.3亿元人民币，税收27亿元人民币，出口创汇14.8亿美元。2002年园区实现高新技术产品产值178亿元，为创建初期9000万元的180多倍。近年来，园区经济总量持续增长，经济质量不断提高，成为福州市经济发展新的增长点，为壮大福州市经济总量、提高经济质量作出了贡献。