作为福建自贸试验区三片区之一，平潭将重点建设自由港和国际旅游岛，充分发挥“自贸区+实验区”叠加优势，突出两岸合作窗口、国家对外开放窗口的作用，打造两岸主平台、主通道、主枢纽。
据平潭综合实验区管委会副主任周青松在福建省政府新闻发布会上介绍，平潭自贸区与福建其他片区相比有三个特色：一是平潭自由贸易试验区是在平潭综合实验区基础上开展试验，在政策上可以实现叠加；二是平潭突出面向自由港方向发展，在推进投资贸易自由、服务贸易自由、航运自由、人员往来方面更加开放；三是突出两岸融合，台胞在就业生活方面享有更多优惠政策。